沈應奎（?—?），字伯和，號湛源，南直隸常州府武進縣人。
萬曆十三年（1585年）乙酉舉人，授崑山縣教諭，縣令王時熙雅重之。歷裕州知州，被召為刑部主事。遷升汀州知府，終官南京光祿少卿。其妻是「丹陽大俠」邵芳之女。
