南晉郡，中國南北朝時設置的郡。
南朝梁置南晉郡，屬并州。治所在東關縣（今四川省宣漢縣東北，一說在今萬源縣南固軍壩）。轄境相當今四川省宣漢縣東北、萬源縣南部地。紹泰二年（556年）被西魏佔領。西魏改為永昌郡。
