蕭寶源（480年代—502年4月21日），字智淵，齊明帝蕭鸞第五子，母為袁貴妃。
建武元年十一月庚辰（494年12月22日），封廬陵王。出任北中郎將，鎮琅邪城。後改任右將軍，領石頭戍事。建武二年八月丁未（495年9月15日），出任使持節、都督南兗、徐、兗、青、冀五州軍事、後將軍、南兗州刺史。王敬則被殺後，改任都督會稽、東陽、臨海、永嘉、新安五郡軍事、會稽太守。永元元年（499年），進號安東將軍。
中興元年三月乙巳（501年4月14日），蕭衍立蕭寶融為帝，任命蕭寶源為侍中、車騎將軍、開府儀同三司，都督、會稽太守如故。蕭寶源尚未就任，就於中興二年三月丁巳（502年4月21日）去世。
