親緣係數
親緣係數(英語:coefficient of relationship)是兩個個體之間血緣關係(或生物學關係)程度的度量,由休厄爾·賴特於1922年定義,源自他在1921年對近交係數的定義。該衡量方法常用於遺傳學和系譜學。近交係數用於單個個體,通常為父本與母本之間的親緣係數的二分之一。
一般來說,近交程度越高,親本之間的關係係數越接近1,以百分比表示[a],對於遺傳關係很遠的共同祖先的個體,其數值接近0。
親緣係數
編輯兩個個體B和C之間的親緣係數(r)可通過對它們與共同祖先相連的每條路徑的係數進行求和獲得。每條這樣的線都經由一個共同的祖先將兩個人連接起來,通過非共同祖先個體的次數不多於一次。相差n代的祖先A和後代O之間的路徑係數如下:
其中fA和fO分別是A和O的近交係數。
親緣係數rBC可通過對所有路徑係數求和獲得:
假設譜系可以追溯到一個足夠遙遠的完全隨機繁殖的種群(對於求和計算中的所有A,fA = 0),則r的定義可以簡化為
其中p枚舉連接經由一個共同祖先連接B和C的所有路徑(即所有路徑於共同祖先終止,不再經共同祖先向上追索到共同祖先的祖先),L(p)是路徑p的長度。
舉一個虛構的例子:假設兩人在n = 5代前有32個共同祖先,但在4代以內無任何共同祖先,則他們的親緣係數為
- ,當n = 5時為 ,約等於0.0313或3%。
相同條件下,可追索到十代前1024位祖先的兩人的親緣係數為r = 2-10 = 0.1%。如果雙方個體的族譜在5代內已知,則r的值可以達到百分之幾的準確度,如果已知至少10代,則精度為百分之零點幾。20代前的共同祖先(人類譜系中大約對應500年的時間尺度)對r的貢獻低於百萬分之一。
人類關係
編輯親緣係數有時用於在人類家譜中量化表示親屬關係的程度。
在人類關係中,親緣係數的值通常是根據相對較少代數的完整族譜來計算得出的,可能是三到四代。如上所述,這樣計算的親緣係數的值因而是一個下限,實際值有可能高出多達幾個百分點。如果兩人的完整家譜的已知深度為七代,則誤差在1%以內。[c]
參見
編輯注釋
編輯參考文獻
編輯參考書目
編輯- Wright, Sewall. Systems of Mating (PDF). Genetics. 1921, 6 (2): 111–178 [2022-06-14]. PMC 1200510 . doi:10.1093/genetics/6.2.111. (原始內容存檔 (PDF)於2015-09-24). five papers:
- I) The biometric relations between offspring and parent
- II) The effects of inbreeding on the genetic composition of a population
- III) Assortative mating based on somatic resemblance
- IV) The effects of selection
- V) General considerations
- Wright, Sewall. Coefficients of inbreeding and relationship. American Naturalist. 1922, 56 (645): 330–338 [2022-06-14]. S2CID 83865141. doi:10.1086/279872. (原始內容存檔於2022-06-16).
- Malécot, G. (1948) Les mathématiques de l』hérédité, Masson et Cie, Paris.
- Lange, K. (1997) Mathematical and statistical methods for genetic analysis, Springer-Verlag, New-York.
- Oliehoek, Pieter; Jack J. Windig; Johan A. M. van Arendonk; Piter Bijma. Estimating Relatedness Between Individuals in General Populations With a Focus on Their Use in Conservation Programs. Genetics. May 2006, 173 (1): 483–496. PMC 1461426 . PMID 16510792. doi:10.1534/genetics.105.049940.