圆囊藻属（学名：Ascocyclus）为索藻科的一个属。
圆囊藻属
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科学分类 
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| 界：
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色藻界 Chromista
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| 门：
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淡色藻门 Ochrophyta
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| 纲：
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褐藻纲 Phaeophyceae
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| 目：
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水云目 Ectocarpales
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| 科：
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索藻科 Chordariaceae
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| 属：
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圆囊藻属 Ascocyclus
Magnus, 1874
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| 种
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见正文
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本属包括以下物种：[1]
- 二层圆囊藻 Ascocyclus distromaticus Taylor
- Ascocyclus hypneae Børgesen
- Ascocyclus ocellatus (Kützing) Reinke
- 圆形圆囊藻 Ascocyclus orbicularis (J.Agardh) Kjellm.
