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布雷-柯蒂斯相异度

布雷-柯蒂斯相异度（英语：Bray–Curtis dissimilarity）是一个生态学和生物学术语，由J. Roger Bray和John T. Curtis[1]提出，基于物种多度对不同样地物种组成差异进行衡量的测度。其计算公式是：

其中，和分别是两个调查样地的编号，是两个样地共有物种的多度较小值之和，和分别是两个样地的物种多度之和。关于计算的拓展阅读请参见Legendre & Legendre[2]。

布雷-柯蒂斯相异度介于0和1之间，0意味着两个调查样地的物种组成完全相同，而1则表示两个调查样地的物种组成完全不同。

布雷-柯蒂斯相异度经常被误认为是一种距离测度（"距离的定义应当基于三角不等式，但是很多差异性的度量并不具有该属性，为了区别这些差异性度量和距离度量，我们称它们为‘相异度’”[3])）。由于它不满足三角不等式，我们应当称之为“相异度”而非“距离”，以避免混淆。一些软件如mothur软件包提供了计算大量调查样地之间相异度的方法[4]。

布雷-柯蒂斯相异度和雅卡尔指数（英语：Jaccard index）相似，但是由于布雷-柯蒂斯相异度是半度量的，所以雅卡尔指数可能会是更好的选择[5]。

参考文献 编辑

  1. ^ Bray, J. R. and J. T. Curtis. 1957. An ordination of upland forest communities of southern Wisconsin. Ecological Monographs 27:325-349.
  2. ^ Pierre Legendre & Louis Legendre. 1998. Numerical ecology. 2nd English edition. Elsevier Science BV, Amsterdam.
  3. ^ Chapter 5 Measures of distance between samples: non-Euclidean (PDF). [2019-10-10]. （原始内容存档 (PDF)于2017-10-16）. 
  4. ^ Braycurtis - mothur. www.mothur.org. [2019-10-10]. （原始内容存档于2015-02-20）. 
  5. ^ R: Dissimilarity Indices for Community Ecologists. cc.oulu.fi. [2019-10-10]. （原始内容存档于2019-07-29）. 

延伸阅读 编辑

  • Czekanowski J (1909) Zur Differentialdiagnose der Neandertalgruppe. Korrespbl dt Ges Anthrop 40: 44–47.
  • Somerfield, PJ (2008) Identification of Bray-Curtis similarity index: comment on Yoshioka (2008). Mar Ecol Prog Ser 372: 303–306.
  • Yoshioka PM (2008) Misidentification of the Bray-Curtis similarity index. Mar Ecol Prog Ser 368: 309–310. http://doi.org/10.3354/meps07728
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