毛三元（？—1850年），四川省潼川府盐亭县（今四川省盐亭县），清朝军事将领、武进士出身。
道光十一年，武举中式；道光十二年，登武进士，授蓝翎侍卫。道光十九年，任云南景蒙营中军守备。道光二十二年，署维西协中军都司。道光二十三年兼任游击。道光二十五年，任元江营中军守备，署腾越镇标左营都司。道光二十七年，署右营都司。道光二十八年，署普洱镇标中营守备。道光三十年，赠云骑尉[1]。
