生物分类学

生物分类学（英语：biotaxonomy）简称分类学（taxonomy），是关于生物个体的鉴定（identification）、归类（classification）和命名（nomenclature）的原理和方法的学科；此三要件间有相互依存的关系。生物分类学范围包括：研究生物类群间的异同程度，阐明生物间的亲缘关系、演化过程和发展规律。^[1]

要将生物分类，首先要知道生物与非生物的定义，但是我们似乎没有办法准确定义，以病毒来说，虽然可在其他生物体内寄生并复制，但在生物体外却没有一般生物的特征如制造或摄取营养，生殖等现象。又如引起疯牛病的朊粒（prion）可以造成感染却无DNA成分，一直以来，DNA被视为生命遗传物质，经由与RNA的转录转译过程，形成蛋白质，再进一步形成组成细胞的各个部分，如细胞膜、胞器等，而细胞则是我们长久以来所认为组成生命体的最小单位。

生物命名规范

关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（International Code of Botanical Nomenclature，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规（英语：International Code of Nomenclature of Bacteria）》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。

生物分界(kingdom)和域(domain)

传统上，生物分为五界(kingdom)，

原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)

Copeland提出过四界说：

原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界

也有人使用三域系统说。这种分类方法是依据细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。

古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)

另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。

病毒 -- 类病毒 -- 朊粒

卡尔·林奈 1735^[2]	恩斯特·海克尔 1866^[3]	埃德·查顿（英语：Édouard Chatton） 1925^[4]	赫伯特·科普兰（英语：Herbert Copeland） 1938^[5]	罗伯特·魏泰克 1969^[6]	卡尔·乌斯 et al. 1990^[7]	汤玛斯·卡弗利尔-史密斯 1998^[8]
2 界	3 界	2域系统（英语：two-empire system）	界 (生物)	界 (生物)	三域系统	界 (生物)
（未论述）	原生生物	原核生物	原核生物界	原核生物界	细菌	细菌
		原核生物	原核生物界	原核生物界	古菌	细菌
		真核生物	原生生物	原生生物	真核生物	原生动物
			原生生物	原生生物		色藻界
植物	植物		植物	植物		植物
植物	植物		植物	真菌		真菌
动物	动物		动物	动物		动物

分类表

生物分类总表

这个列表以NCBI Taxonomy （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的分类为基础^{[注 1]}。

真菌/后生动物组

真菌/后生动物组除动物界和真菌外，还包含领鞭毛虫、鱼醉菌等。

动物界

即“后生动物”组。

真菌界

包括子囊菌、担子菌、接合菌、壶菌、聚合菌和微孢子虫。

其余真核生物（原生生物和真核藻类）

真核生物除动物、植物、真菌三界之外统称原生生物，为并系群。

等辐骨虫纲（Acantharea），如等棘虫。
放射虫纲
双滴虫类（Diplomonadida），如曲滴虫、贾第虫。
Parabasalidea
- 毛滴虫纲（Trichomonada）
- 超鞭毛纲（Hypermastigia）
异叶足纲（Heterolobosea），如集胞菌。
眼虫门
- 动质体目（Kinetoplastida）
- 眼虫纲
隐藻纲（Cryptophyta）
定鞭藻纲（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
不等鞭毛类，除下列分类还包括辐球虫、蛙片虫等。
- 金藻纲
- 硅鞭藻纲（Dictyochophyceae）
- 针胞藻纲（Raphidophyceae）
- 前毛壶菌纲（Hyphochytriomycetes）
- 卵菌纲
- 褐藻门，如海带、巨藻、马尾藻、墨角藻。
- 硅藻门
- 黄藻门
囊泡虫类
- 顶复门，如疟原虫。
- 纤毛虫类，如喇叭虫、中缢虫、榴弹虫、草履虫、四膜虫。
- 甲藻门
单孢子虫门（Haplosporidia）
丝足虫类
根肿菌类（Plasmodiophorida）
粒网足虫类（Granuloreticulosea），如有孔虫。
叶足纲（Lobosea），如变形虫（阿米巴）。
黏菌门
灰胞藻纲（Glaucocystophyceae）
红藻门，如石花菜、紫菜。

注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未归类原生生物。

参见

注释

^ 其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意区别。

参考文献

^ 中国大百科智慧藏：分类学. [2019-07-30]. （原始内容存档于2020-10-06）.
^ Linnaeus, C. Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per classes, ordines, genera & species. 1735.
^ Haeckel, E. Generelle Morphologie der Organismen. Reimer, Berlin. 1866.
^ Chatton, É. Pansporella perplexa. Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires. Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale. 1925, 10–VII: 1–84.
^ Copeland, H. The kingdoms of organisms. Quarterly Review of Biology. 1938, 13: 383–420. doi:10.1086/394568.
^ Whittaker, R. H. New concepts of kingdoms of organisms. Science. January 1969, 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci...163..150W. PMID 5762760. doi:10.1126/science.163.3863.150.
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^ Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biological Reviews. 1998, 73 (03): 203–66. PMID 9809012. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x.

[9] 其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意区别。

[1] 中国大百科智慧藏：分类学. [2019-07-30]. （原始内容存档于2020-10-06）.

[Linnaeus1735-2] Linnaeus, C. Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per classes, ordines, genera & species. 1735.

[Haeckel-3] Haeckel, E. Generelle Morphologie der Organismen. Reimer, Berlin. 1866.

[Chatton1925-4] Chatton, É. Pansporella perplexa. Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires. Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale. 1925, 10–VII: 1–84.

[Copeland1938-5] Copeland, H. The kingdoms of organisms. Quarterly Review of Biology. 1938, 13: 383–420. doi:10.1086/394568.

[Whittaker1969-6] Whittaker, R. H. New concepts of kingdoms of organisms. Science. January 1969, 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci...163..150W. PMID 5762760. doi:10.1126/science.163.3863.150.

[Woese1990-7] Woese, C.; Kandler, O.; Wheelis, M. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1990, 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159  . PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576.

[CavalierSmith2004-8] Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biological Reviews. 1998, 73 (03): 203–66. PMID 9809012. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x.

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