叶意深(?—?),字曼卿,为中国清朝官员,浙江慈溪人。
举人出身的叶意深于1889年(光绪十五年)接替李淦担任台湾府淡水县知县一职,是该县的地方父母官。1892年调署新竹知县,1895年,则转任台湾县知县,是年,因福建台湾省遭清朝割让予日本,他奉旨内渡。1898年(光绪二十四年)补江苏金匮(今无锡)知县。