卫贞元,山西省泽州府阳城县(今山西省阳城县)人,清朝政治人物、进士出身。
顺治二年(1645年)乙酉科顺天乡试举人,顺治三年(1646年),联登进士,后任商城县知县[1]。顺治十五年,任江宁巡按御史[2]。