邻接法
生物信息学术语
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邻接法（英文：neighbor-joining method；又称 NJ 法），生物信息学术语，是一种用于构建系统发生树（演化树）的快速聚类方法，由日本遗传学家斋藤成也（平文式罗马字：Saitou Naruya）和日裔美国生物学家根井正利（Nei Masatoshi）二人在1987年创立[2]。使用邻接法构建演化树时，通常需要基于 DNA 序列或蛋白质数据，以此了解每对分类单元之间的距离，通过确定距离最近（或相邻）的成对分类单元使演化树的总距离达到最小，循环地将相邻点合并成新的点，最终形成完整的树型[3][4]。
邻接法不需要关于分子钟的假设，不考虑任何优化标准，基本思想是进行类的合并时，不仅要求待合并的类是相近的，而且要求待合并的类远离其他的类，从而通过对完全没有解析出的星型演化树进行分解，来不断改善星型演化树[5]。
参阅 编辑
参考文献 编辑
- ^ モンゴロイドの形成. 九州大学総合研究博物馆.（日语）
- ^ Saitou, N. & Nei, M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution. 1987-07-01, 4 (4): 406–425 [2020-09-19]. PMID 3447015. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
. 原始内容存档于2014-12-25.
- ^ Didelot, Xavier. "Sequence-Based Analysis of Bacterial Population Structures". Robinson, D. Ashley; Falush, Daniel & Feil, Edward J (编). Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Hoboken, NJ: John Wiley and Sons. 2010: 46–47 [2021-07-02]. ISBN 978-0-470-42474-2. （原始内容存档于2021-07-25）.
- ^ 第二届植物学名词审定委员会 (编). 植物学名词 (2版). 北京: 科学出版社. 2019 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-062178-8. （原始内容存档于2021-10-23）.（简体中文）
- ^ 古生物学名词审定委员会 (编). 古生物学名词 (2版). 北京: 科学出版社. 2009 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-025433-7. （原始内容存档于2021-10-23）.（简体中文）
