邓士奇(?年—?年),广西横州人,明朝官员。
万历三十一年(1603年)癸卯科解元,治《诗经》[1][2],万历间任四川邻水县知县。
崇祯四年(1631年)任丰县儒学教谕[3]。
父邓国材,万历七年己卯科举人,曾任湖南衡山县知县。