阅读框架
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阅读框架（英语：Reading Frame）在分子生物学中是指将mRNA的碱基序列划分成连续、互不重叠的三元组的方式或这样的划分方式在相应DNA上的对应。这样的三元组称为密码子。每个密码子可编码一个氨基酸或作翻译的终止信号。
通常我们把一条核酸链的5'端（磷酸基团端）称为首端，将其3'端称为尾端。翻译时核糖体读取mRNA的方向为5'端到3'端。阅读框架一共有三种，划分各相隔一个碱基[1][2]。
通常来说，一段碱基序列只采用一种阅读框架（这种阅读框架称为开放阅读框（ORF）），而另外两种读框则因为会频繁出现终止密码子而被关闭[3]。但在一些病毒内，一段碱基序列却可以采用多种重叠的读框[4]。哺乳动物也有相似的例子：由线粒体DNA中编码ATP酶的两个亚基的区域转录出的mRNA在同一序列区域有阅读框架重叠的现象。
开放阅读框
编辑一个开放阅读框（ORF）指mRNA采用这种读框可以翻译出多肽链的阅读框。在起始密码子后，会紧跟着一段编码氨基酸的密码子，最后，翻译会停止于终止密码子处[5]。
阅读框架重叠
编辑参考
编辑- ^ Rainey S, Repka J. Quantitative sequence and open reading frame analysis based on codon bias (PDF). Systemics, Cybernetics and Informatics: 65–72. [2015-11-13]. （原始内容存档 (PDF)于2020-08-06）.
- ^ Badger JH, Olsen GJ. CRITICA: Coding Region Identification Tool Invoking Comparative Analysis. Mol Biol Evol. April 1999, 16 (4): 512–24 [2015-11-13]. PMID 10331277. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026133. （原始内容存档于2019-12-20）.
- ^ Jocelyn E. Krebs; et al. Lewin's Genes XI. JONES&BARTLETT LEARNING. 2014: pp.37. ISBN 978-7-04-039649-2.
- ^ Lander, Eric. MITx 7.00x Biology. [2015-11-13]. （原始内容存档于2019-12-07）.
- ^ Benjamin C. Pierce. Genetics: a conceptual approach. W. H. Freeman. 2012. ISBN 9781429232500.
- ^ Johnson Z, Chisholm S. Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes. Genome Res. 2004, 14 (11): 2268–72. PMC 525685
. PMID 15520290. doi:10.1101/gr.2433104.
