吴宝秀（？—1600年），字汝珍，号惺台。浙江平阳县河前（今浙江省龙港市湖前）人。明朝政治人物。
吴宝秀为南宋进士吴通之后。万历十年（1582年）中己丑科举人，万历十七年（1589年）中己丑科进士，官拜大理寺评事，后被贬南康府知府。万历二十七年（1599年），与湖口的税监李道结怨，下诏狱。妻陈氏闻讯上吊死。后为太监田义所搭救，移至刑部。九月，贬为庶民，次年病死。
天启年间平反，追赠为太仆少卿。其子吴凤起官至刑部主事，孙吴元震为康熙十一年（1672年）壬午贡生。《明史》卷二百三十七有传。
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