林起元（？—1638年），字斗建，山东登州府宁海州文登县人，明朝政治人物。
崇祯六年（1633年）癸酉科山东乡试举人，十年（1637年）丁丑科进士。授直隶南宫县知县，十一年（1638年）清军入关骚扰，破南宫，林起元夫妻殉难[1]。
