海线藻科（学名：Thalassionemataceae）为海线藻目的一个科。
海线藻科
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科学分类 
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| 界：
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色藻界 Chromista
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| 门：
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淡色藻门 Ochrophyta
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| 纲：
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硅藻纲 Bacillariophyceae
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| 目：
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海线藻目 Thalassionematales
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| 科：
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海线藻科 Thalassionemataceae
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| 属
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见正文
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本科包括以下属：
- Lioloma Hasle, 1997
- Spinigera H.Heiden & R.W.Kolbe, 1928
- 海线藻属 Thalassionema A.Grunow ex C.Mereschkowsky, 1902
- 海毛藻属 Thalassiothrix P.T.Cleve & A.Grunow, 1880
- Thallossionema
- Trichotoxon F.M.Reid & F.E.Round, 1988
