猪急性腹泻综合征冠状病毒

猪急性腹泻综合征冠状病毒学名:Swine acute diarrhea syndrome coronavirus),简称SADS冠状病毒(SADS-CoV),又称猪肠道甲型冠状病毒(Porcine enteric alphacoronavirus)[1],是甲型冠状病毒属的一种病毒,可感染,造成严重的腹泻疫情。此病毒很有可能起源自感染蝙蝠的病毒。

猪急性腹泻综合征冠状病毒
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 甲型冠状病毒属 Alphacoronavirus
种:
猪急性腹泻综合征冠状病毒 Swine acute diarrhea syndrome coronavirus

名称

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猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS冠状病毒)发现之初曾被称为“新型冠状病毒[2]2019冠状病毒病疫情爆发时有网络消息将此病毒与造成疫情的严重急性呼吸综合征冠状病毒2型混淆,实则两病毒属于不同的,且SADS冠状病毒仅能感染猪,尚无证据显示其具有感染人类的能力[3]

研究历史

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2016年10月,中国广东清远的一处养猪场爆发猪只疫情,症状包括腹泻与呕吐,出生五天内的小猪被感染的死亡率高达九成,出生八天以上的猪只被感染的死亡率则约为5%。初期病死的猪只小肠中验出了猪流行性腹泻病毒(PEDV),且该养猪场过去即有爆发过PEDV感染的疫情,因此最初认定此次疫情亦是PEDV所致,然而2017年1月起,病死猪的样本中不再检测出PEDV,养猪场的猪只死亡数却持续上升,也未发现其他已知的猪病毒。不久后附近三座养猪场亦爆发类似疫情,截至同年5月在四座养猪场共造成24693头猪只死亡[4]

元基因组学研究结果显示此疫情为一种新的冠状病毒所致,即猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV),于2018年由华南农业大学研究员马静云与武汉病毒研究所研究员石正丽等人的研究团队发表于《自然[5][6]。此病毒的基因序列有高达95%与菊头蝠冠状病毒HKU2(Bat-CoV HKU2)相同,且后者曾在养猪场附近的蝙蝠洞中被检测出,另外从2013年-2016年于广东各地采集的菊头蝠样本经定序后,亦发现四种病毒与猪急性腹泻综合征冠状病毒序列相似度高达96%-98%,因此此病毒很有可能即是起源自感染蝙蝠的病毒[4][7][8]

2018年,福建七座养猪场发生腹泻的小猪粪便与小肠样本中亦检测出了猪急性腹泻综合征冠状病毒[9]。2019年2月,最早爆发疫情的广东清远养猪场附近,又有另一座养猪场爆发腹泻疫情,造成约2000头猪只死亡,经检验发现又是猪急性腹泻综合征冠状病毒感染所致[10]。同年有研究显示此病毒在体外除了猪以外,还可感染多种人类、猴子老鼠仓鼠沙鼠等动物的细胞系,且老鼠体内实验结果显示此病毒可感染其脾脏中的树突细胞,并在其中复制增殖[11]

病毒学

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猪急性腹泻综合征冠状病毒属甲型冠状病毒属,为具包膜正链RNA病毒,其基因组长度约为27000nt,共有九个开放阅读框,编码ORF1a、ORF1b、刺突蛋白(S)、包膜蛋白(E)、膜蛋白(M)、衣壳蛋白(N)以及NS3a、NS7a和NS7b等三种辅助蛋白。此病毒感染目前尚无疫苗可预防[1]

参见

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参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 Sun, Y.; Cheng, J.; Luo, Y.; Yan, X.L.; Wu, Z.X.; He, L.L.; Tan, Y.R.; Zhou, Z.H.; Li, Q.N.; Zhou, L.; Wu, R.T.; Lan, T.; Ma, J.Y. Attenuation of a virulent swine acute diarrhea syndrome coronavirus strain via cell culture passage. Virology. 2019, 538: 61–70. ISSN 0042-6822. doi:10.1016/j.virol.2019.09.009. 
  2. ^ 丁佳、甘晓. 武汉病毒所未卜先知?. 中国科学报. 2020-02-22 [2020-02-24]. (原始内容存档于2020-02-24). 
  3. ^ 应悦、徐美慧. 北京菜市场供货不足?这些谣言不可信. 新京报. 2020-01-28 [2020-02-24]. (原始内容存档于2020-02-24). 
  4. ^ 4.0 4.1 Zhou, Peng; Fan, Hang; Lan, Tian; Yang, Xing-Lou; Shi, Wei-Feng; Zhang, Wei; Zhu, Yan; Zhang, Ya-Wei; Xie, Qing-Mei; Mani, Shailendra; Zheng, Xiao-Shuang; Li, Bei; Li, Jin-Man; Guo, Hua; Pei, Guang-Qian; An, Xiao-Ping; Chen, Jun-Wei; Zhou, Ling; Mai, Kai-Jie; Wu, Zi-Xian; Li, Di; Anderson, Danielle E.; Zhang, Li-Biao; Li, Shi-Yue; Mi, Zhi-Qiang; He, Tong-Tong; Cong, Feng; Guo, Peng-Ju; Huang, Ren; et al. Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related coronavirus of bat origin. Nature. 2018, 556 (7700): 255–258. Bibcode:2018Natur.556..255Z. PMID 29618817. doi:10.1038/s41586-018-0010-9. 
  5. ^ 张家伟. 研究发现一种新型猪冠状病毒源自蝙蝠. 新华社. 2018-04-05 [2020-02-17]. (原始内容存档于2020-02-22). 
  6. ^ 黄浩苑. 华南农大研究人员“挖出”2万余仔猪病死的“元凶”. 新华社. 2018-04-08 [2020-02-24]. (原始内容存档于2018-06-15). 
  7. ^ MELODY SCHREIBER. A Novel Virus Killed 24,000 Piglets In China. Where Did It Come From?. National Public Radio. 2018-04-04 [2020-02-17]. (原始内容存档于2020-01-12). 
  8. ^ Cui, Jie; Li, Fang; Shi, Zheng-Li. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nature Reviews Microbiology. 2018, 17 (3): 181–192. ISSN 1740-1526. doi:10.1038/s41579-018-0118-9. 
  9. ^ Li, Kai; Li, Hao; Bi, Zhen; Gu, Jun; Gong, Wang; Luo, Suxian; Zhang, Fanfan; Song, Deping; Ye, Yu; Tang, Yuxin; Matthijnssens, Jelle. Complete Genome Sequence of a Novel Swine Acute Diarrhea Syndrome Coronavirus, CH/FJWT/2018, Isolated in Fujian, China, in 2018. Microbiology Resource Announcements. 2018, 7 (22). ISSN 2576-098X. doi:10.1128/MRA.01259-18. 
  10. ^ Zhou, Ling; Li, Qian N.; Su, Jiang N.; Chen, Gui H.; Wu, Zi X.; Luo, Ying; Wu, Rui T.; Sun, Yuan; Lan, Tian; Ma, Jing Y. The re‐emerging of SADS‐CoV infection in pig herds in Southern China. Transboundary and Emerging Diseases. 2019, 66 (5): 2180–2183. ISSN 1865-1674. doi:10.1111/tbed.13270. 
  11. ^ Yang, Yong-Le; Qin, Pan; Wang, Bin; Liu, Yan; Xu, Guo-Han; Peng, Lei; Zhou, Jiyong; Zhu, Shu Jeffrey; Huang, Yao-Wei; Gallagher, Tom. Broad Cross-Species Infection of Cultured Cells by Bat HKU2-Related Swine Acute Diarrhea Syndrome Coronavirus and Identification of Its Replication in Murine Dendritic Cells In Vivo Highlight Its Potential for Diverse Interspecies Transmission. Journal of Virology. 2019, 93 (24). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01448-19.