军舰旗（FIAV符号：
）是军舰悬挂以表示所属海军的海上旗帜，同时亦表明了船只的军用身份，通常在舰尾或主桅悬挂。在航行及日出至日落的停泊期间均会悬挂军舰旗。部分国家的海军在作战中往往会同时在桅杆上悬挂几面船旗，因为传统上认为降下船旗代表投降[1]。
根据《联合国海洋法公约》第20条约定潜水船及其他水中航行机器，在沿岸国的领海时必须在海面上航行并悬挂起所属的旗帜。对潜艇而言，如悬挂起军舰旗则与其他军舰无异，在沿岸国的领海时无损其通航权。
政府船只（如海岸警卫队）及商船另有设计商船旗，若干海军另有制定舰艏旗，悬挂在舰艏。
英国海军不列颠尼亚号：舰尾和主桅杆悬挂军舰旗，另在桅杆悬挂海军级别旗，舰艏悬挂舰艏旗。
部分国家并未单独制定单独的军舰旗、商船旗及政府船旗，而仅使用国旗的设计。另一些国家则使用国旗的变体，或单独设计海军旗。其设计可分类如下：
英国皇家海军的军舰旗是白船旗。旗面为白地红十字，左上方为国旗。其设计影响了众多前英国殖民地国家及其他国家的海军旗设计：
部分国家海军旗使用叠加军徽或锚形的旗帜作为海军旗：
部分国家海军旗使用国旗的长比例变体：
北欧及中东欧国家的海军旗多采用国旗的燕尾形式：
苏联自1935年采用白底，下方蓝边的海军旗设计，影响了部分前社会主义国家：
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 苏联 （1950-1992） |
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）是军舰悬挂以表示所属海军的海上旗帜，同时亦表明了船只的军用身份，通常在舰尾或主桅悬挂。在航行及日出至日落的停泊期间均会悬挂军舰旗。部分国家的海军在作战中往往会同时在桅杆上悬挂几面船旗，因为传统上认为降下船旗代表投降[1]。
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