柯元芳(?年—?年),字楚衡,浙江嘉善县(今浙江省嘉兴市)人。明朝政治人物,崇祯进士。
天启元年(1621年)辛酉科浙江乡试第二十二名举人[1],崇祯十年(1637年)丁丑科进士。任福建建宁府推官,任内宽仁明允,多有平反[2]。历署瓯宁、浦城二县事。崇祯十七年(1644年)国破归里。卒年六十二[3]。