万建崑(?—?),字季瑜,江西南昌府南昌县东溪人,明朝政治人物。同进士出身。万廷言长子。
万历十七年(1589年)进士,担任湖广荆州府推官。博学多问,治案公正,“老吏皆惮焉”。升礼部主事。因“第一次妖书案”谪戍广西思恩军民府武缘县(今广西壮族自治区武鸣县)典史[1]。