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淡色藻亚门
域：
真核生物域
演化支：
双鞭毛生物
演化支：
SAR超类群
演化支：
不等鞭毛类
不等鞭毛类
参见
不等鞭毛类
淡色藻门
见下 ↓
淡色藻亚门
淡
色
藻
亚
门
矽藻下门
（
英语
：
Diatomista
）
迅游藻纲
（
英语
：
Bolidophyceae
）
矽鞭藻纲
（
英语
：
Dictyochophyceae
）
矽鞭藻目
（
英语
：
Dictyochales
）
佛罗伦斯藻目
（
英语
：
Florenciellales
）
金须藻目
（
英语
：
Pedinellales
）
根色藻目
（
英语
：
Rhizochromulinales
）
浮生藻纲
（
英语
：
Pelagophyceae
）
浮生藻目
（
英语
：
Pelagomonadales
）
四叠金藻目
（
英语
：
Sarcinochrysidales
）
Plocamiomonadales
（
英语
：
Plocamiomonadales
）
矽藻纲
埃勒贝克藻类
（
英语
：
Ellerbeckiophytina
）
鼻状藻类
（
英语
：
Probosciophytina
）
直链藻类
（
英语
：
Melosirophytina
）
圆筛藻类
（
英语
：
Coscinodiscophytina
）
根管藻类
（
英语
：
Rhizosloleniophytina
）
蜘网藻类
（
英语
：
Arachnoidiscophytina
）
细柱藻类
（
英语
：
Leptocylindrophytina
）
细柱藻纲
（
英语
：
Leptocylindrophyceae
）
棘冠藻纲
（
英语
：
Corethrophyceae
）
矽藻类
（
英语
：
Bacillariophytina
）
中心矽藻纲
（
英语
：
Mediophyceae
）
角毛藻亚纲
（
英语
：
Chaetocerotophycidae
）
石丝藻亚纲
（
英语
：
Lithodesmiophycidae
）
海链藻亚纲
（
英语
：
Thalassiosirophycidae
）
波纹藻亚纲
（
英语
：
Cymatosirophycidae
）
齿状藻亚纲
（
英语
：
Odontellophycidae
）
金盘藻亚纲
（
英语
：
Chrysanthemodiscophycidae
）
盒形藻纲
（
英语
：
Biddulphiophyceae
）
盒形藻亚纲
（
英语
：
Biddulphiophycidae
）
四棘藻属
矽藻纲
条纹藻亚纲
（
英语
：
Striatellaceae
）
Urneidophycidae
（
英语
：
Urneidophycidae
）
脆杆藻亚纲
（
英语
：
Fragilariophycidae
）
矽藻亚纲
（
英语
：
Bacillariophycidae
）
金藻下门
（
英语
：
Chrysista
）
见下 ↓
金藻下门
（
英语
：
Chrysista
）
金
藻
下
门
（
英语
：
Chrysista
）
Chrysoderma
（
英语
：
Chrysoderma
）
Chrysomeris
（
英语
：
Chrysomeris
）
Chrysonephos
（
英语
：
Chrysonephos
）
Giraudyopsis
（
英语
：
Giraudyopsis
）
Rhamnochrysis
（
英语
：
Rhamnochrysis
）
SII
同色藻纲
（
英语
：
Picophagea
）
滑盘藻纲
（
英语
：
Olisthodiscophyceae
）
脂藻纲
（
英语
：
Pinguiophyceae
）
大眼藻纲
角色藻目
（
英语
：
Goniochloridales
）
大眼藻目
Paraeustigmatos
（
英语
：
Paraeustigmatos
）
大眼藻科
Monodopsidaceae
（
英语
：
Monodopsidaceae
）
Neomonodaceae
（
英语
：
Neomonodaceae
）
金藻纲
Chryososaccus
（
英语
：
Chryososaccus
）
Chrysosphera
（
英语
：
Chrysosphera
）
Cyclonexis
（
英语
：
Cyclonexis
）
Lygynion
（
英语
：
Lygynion
）
Phaeoplaca
（
英语
：
Phaeoplaca
）
单鞭金藻目
蛰居金藻目
棕鞭藻目
近囊胞藻目
黄群藻目
SI
见下 ↓
SI
SI
针胞藻纲
金谜藻纲
（
英语
：
Chrysoparadoxophyceae
）
裂枝藻纲
（
英语
：
Schizocladiophyceae
）
褐枝藻纲
（
英语
：
Phaeothamniophyceae
）
褐枝藻目
（
英语
：
Phaeothamniales
）
Pleurochloridales
（
英语
：
Pleurochloridales
）
褐藻纲
袋孢藻目
（
英语
：
Ascoseirales
）
酸藻目
网地藻目
迪斯科藻目
水云目
墨角藻目
铁钉菜属
海带目
线皮藻属
（
英语
：
Nemoderma
）
昂斯洛藻目
（
英语
：
Onslowiales
）
褐壳藻目
落藻目
黑顶藻目
（
英语
：
Sphacelariales
）
毛头藻目
针皮藻目
（
英语
：
Syringodermatales
）
线翼藻目
（
英语
：
Tilopteridales
）
褐囊藻纲
（
英语
：
Phaeosacciophyceae
）
褐囊藻科
（
英语
：
Phaeosaccionaceae
）
Tetrasporopsidaceae
（
英语
：
Tetrasporopsidaceae
）
黄藻纲
黄丝藻目
无隔藻目
（
英语
：
Vaucheriales
）
地位未定
太阳虫目
