梭子草科是被大多數分類法所承認的一類顯花植物。
1981年的《克朗奎斯特分類法》將其分入燈芯草目,鴨跖草亞綱。
1998年的《APG 分類法》將其列入禾本目。
2003年經過修訂的《APG II 分類法》將其和袖珍棕櫚科合併為一科,隸屬於禾本目下。
目前這個科只包括兩屬:梭子草屬和袖珍棕櫚屬,一共只有幾種,都是多年生濕生植物。