深海䲁科其下3個屬，如下：
- 深海䲁屬(Bathymaster)
- 阿拉斯加深海䲁(Bathymaster caeruleofasciatus)
- 鰓斑深海䲁(Bathymaster derjugini)
- 加州深海䲁(Bathymaster hypoplectus)
- 光鱗深海䲁(Bathymaster leurolepis)
- 斑鰭深海䲁(Bathymaster signatus)
- 拉氏䲁屬(Rathbunella)
- 細體拉氏䲁(Rathbunella hypoplecta)
- 真深海䲁屬(Ronquilus)
