管家基因
管家基因(英語:housekeeping gene),又名持家基因、看家基因或家務基因,是指在生物體內所有細胞中都表達,並且為維持細胞基本生命活動所需而時刻都在表達的高度保守的基因。
在細胞生物學中,管家基因(housekeeping genes)通常是維持基本的細胞功能的組成基因,並且在無論正常還是病理條件下都正常表達。儘管一些管家基因會在非病理的條件下以恆定的速率表達,但是其他管家基因的表達可能會因為實驗條件而不同。
「管家基因「一詞的起源是模糊不清的。從1976年的文獻用這個詞語去描述tRNA和rRNA。出於實驗的目的,通常實驗會使用一個或者多個的管家基因的表達量作為其他基因表達水平的參考。在這種實驗中,通常選擇看家基因的關鍵標準是是否這個基因在對照和實驗條件下均以低方差均勻表達。 管家基因在用於基因表達實驗(如 RT-PCR)之前應進行驗證。 近期一個人類和小鼠看家基因和參考基因/轉錄本的網絡數據庫被建立,名為看家和參考轉錄本圖譜(HRT Atlas),為 RT-qPCR 數據提供更新的看家基因列表和可靠的候選參考基因/轉錄本歸一化。該數據庫可以在 http://www.housekeeping.unicamp.br (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) 訪問。
管家基因調控
編輯管家基因對整個基因組的主要活動非常重要,他們的表達明顯對生存起着不可缺少的作用。在身體中,管家基因的表達水平在不同地方微調來滿足不同組織的需求。生物學界在管家基因啟動子起始的生化研究的課題上一直是面臨困難,部分原因是啟動子基序和其實轉錄過程特徵較少。
人類管家基因啟動子普遍缺乏TATA-box,有高的GC含量,高概率能找到CpG島。在不存在啟動子特異性的CpG島不存在的過硬上,管家基因的啟動子包含DNA元件,比如DRE,E-box或者DPE.管家基因的轉錄其實是位點可以跨越大約100bp的區域,而發育調控基因的轉錄起始位點通常集中在一個狹窄的區域。關於管家基因的分散轉錄其實是如何建立的,這方面還很不明朗。有一些轉錄因子專門富集並調節管家基因啟動子。此外,管家啟動子受管家增強子條件,但不受發育調節的增強子調節
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