蛋白質測序

蛋白质中氨基酸连接顺序或一级结构的测定

蛋白質測序是指通過實驗方法對蛋白質氨基酸序列以及其高級結構進行測定。雖然根據中心法則蛋白質的序列可以通過核酸序列進行推定,但對蛋白質進行測序可以對轉錄後修飾(PTM)進行更好的追蹤。一般來說,如果是對較常見物種的蛋白質進行測序,只要確定出蛋白質的部分序列,就能通過與蛋白質序列數據庫進行比對,就能倒推出相關序列來自哪一種蛋白。

使用較早期的蛋白測序儀貝克曼-斯賓科測序儀進行測序的一名技術人員,攝於1970年

最早的蛋白測序法是由弗雷德里克·桑格(Frederic Sanger)發明的。他於1953年對牛胰島素進行了測序,是人類歷史上第一次蛋白測序。後來,桑格使用的這套辦法以他名字得到命名,稱為桑格法[1]。目前,最常用的蛋白質測序方法是蛋白質譜法英語Protein mass spectrometry測序。這種方法中,蛋白質先被分解為較短的段,再通過質譜儀獲得其電荷分子質量之比,進而推斷出氨基酸序列[2]。不過,基於化學反應的埃德曼降解法也仍占一席之地,尤其是對蛋白質的N端(靠近自由氨基基團的一端)進行測序[1]

蛋白質序列解釋:在酵母中改造的新蛋白質方案.

參見

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參考資料

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  1. ^ 1.0 1.1 Büyükköroğlu, Gülay; Dora, Devrim Demir; Özdemir, Filiz; Hızel, Candan. Techniques for Protein Analysis. Omics Technologies and Bio-Engineering. Elsevier. 2018: 317–351. doi:10.1016/b978-0-12-804659-3.00015-4. 
  2. ^ Saraswathy, Nachimuthu; Ramalingam, Ponnusamy. Protein sequencing techniques. Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics. Elsevier. 2011: 193–201. doi:10.1533/9781908818058.193.