二進制檔案(英語:binary file)一般指包含ASCII及擴充ASCII字元中編寫的數據或程式指令(program instructions)的檔案。廣義的二進制檔案即為檔案,由檔案在外部英語External storage儲存裝置的存放方式為二進制而得名。狹義的二進制檔案即指除文字檔案以外的檔案。

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