海軍總司令部(德語:Oberkommando der Marine,常縮寫為「OKM」)是存在於1859年至1871年期間的普魯士皇家海軍最高指揮機關。
在「普魯士戰爭部」部長阿德爾伯特親王(德語:Adalbert von Preußen (1811–1873))的主導下建立了德國人的第一支現代化海軍,並於1859年3月14日將統帥權分離成「海軍總司令部」以及直屬普魯士國王的「海軍局(德語:Marineministerium (Deutschland))」。在德意志帝國建立後,普魯士王國的「海軍總司令部」被併入帝國中央的「帝國海軍部」,其權力分給了後者和「海軍總監(德語:Generalinspekteur der Marine)」。
前後共兩任海軍總司令: