蛋白質交互作用
蛋白質交互作用(英語:Protein–protein interactions,縮寫:PPIs)是指兩種或以上的蛋白質結合的過程,通常旨在執行其生化功能。在細胞中,大量蛋白質元件組成分子機器,透過蛋白質交互作用執行細胞內多數重要的分子過程,如DNA複製。
蛋白質交互作用在絕大多數生化功能中扮演極重要的角色。例如,信號分子經由蛋白質交互作用,將細胞外部的信號傳入內部。這個過程稱為訊息傳遞,是許多生化功能的基礎,也與許多疾病有關,包括癌症。蛋白質亦可透過長時間的交互作用,形成部分的蛋白質複合體,負責攜帶另一個蛋白質,例如從細胞質至細胞核,或反之,如核孔核轉運蛋白的情形;或藉由短暫的交互作用修飾另一個蛋白質,例如負責將磷酸鹽轉移到目標蛋白上的蛋白激酶。蛋白質經修飾後也可能改變其蛋白質交互作用,例如有些SH2結構域的蛋白質只與其他被胺基酸酪胺酸磷酸化的蛋白質結合,布羅莫結構域則專門辨別乙酰離胺酸。
蛋白質交互作用廣泛參與了生物化學、量子化學、分子動力學、訊息傳遞等代謝或遺傳學/表觀遺傳學圖論。事實上,它是所有活體細胞中整個交互作用組學系統的核心。近來,蛋白質交互作用也被應用於奈米生物科技的研究領域。
蛋白質交互作用主宰了活體細胞內幾乎所有的生化反應。透過研究這些交互作用,人們可以更深入了解疾病,進而成為新治療方法的基礎。
延伸閱讀
編輯- De Las Rivas J, Fontanillo C. Lewitter, Fran , 編. Protein-protein interactions essentials: key concepts to building and analyzing interactome networks. PLoS Comput Biol. 2010, 6 (6): e1000807. PMC 2891586 . PMID 20589078. doi:10.1371/journal.pcbi.1000807 (英語).
- Phizicky EM, Fields S. Protein-protein interactions: methods for detection and analysis. Microbiol. Rev. 1995: 94–123. PMC 239356 . PMID 7708014 (英語).
外部連結
編輯- 開放目錄專案中的「Proteins and Enzymes」(英文)
- Biological General Repository for Interaction Datasets (BioGRID)- http://nar.oxfordjournals.org/content/34/suppl_1/D535.full (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- Human Portein Reference Database (HPRD)- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14681466 (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- IntAct Molecular Interaction Database - http://nar.oxfordjournals.org/content/32/suppl_1/D452.abstract (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- Molecular Interactions Database (MINT) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17135203 (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- MIPS Protein Interaction Resource on Yeast (MIPS-MPact) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16381906 (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- MIPS Mammalian Protein-Protein Interaction Database (MIPS-MPPI) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15531608 (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- Library of Modulators of Protein-Protein Interactions (PPI) - http://www.chemdiv.com/portfolio/library-of-modulator-of-protein-protein-interactions-ppi/ (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- Casado-Vela J, Matthiesen R, Sellés S, Naranjo, JR Protein-Protein Interactions: Gene Acronym Redundancies and Current Limitations Precluding Automated Data Integration (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館) Proteomes 2013, 1(1), 3-24.