水稻基因組(英語:Rice genome)是水稻Oryza sativa)的基因組。共組成12個染色體。大約含有4億3千萬個DNA鹼基對(以氫鍵相結合的兩個含氮鹼基),其中的一些鹼基對,組成了約38000個基因,這個數字約是人類基因數目的1.7倍。

來自11個國家的團隊,在國際水稻基因組定序計劃中調查水稻與一些栽培亞種的基因組DNA序列,在2005年8月發表了初步的結果。

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