馬兆羲（？—17世紀），雲南楚雄府楚雄縣人[1]，明朝、南明政治人物。
馬兆羲是崇禎元年（1628年）進士，任職工科給事中，負責巡查廠庫，清出盜鑄的濫錢四十餘萬。寧州土司祿永命爭奪襲位，他就請求留下撫臣王育德控制以防變亂[1]。弘光帝繼位，改任禮科給事中兼禮部郎中，上疏請改毅宗的廟號；到隆武帝即位，徵召馬兆羲入禮科，兼任職方郎中，福京失陷後回鄉。永曆二年（1648年），孫可望命令他督學雲南，擢任為可望行營的戶部尚書，轉兵部尚書時他不應召；很快就除授禮部右侍郎，主管永曆八年的貴州鄉試。孫可望失敗投降清朝後，馬兆羲被降為國子學士[2]，之後後事不詳。
