马元调(?—1645年),字巽甫,又字简堂,直隶苏州府嘉定县人,明末藏书家、经学家。
早年为诸生,师从娄坚,精通经史,论断精确,并出版元稹、白居易的作品集(《元氏长庆集》与《白氏长庆集》)。黄淳耀称赞他:“今先生于残山剩水间,独抱遗经,使后世读书种子不绝,莫大之功也。”弘光元年(1645年)闰六月十七日,清军围堵嘉定,马元调协守东门,坚持十余日,城破殉难。