周仲孫(?—?),字元孫,東晉汝南郡安成縣(今河南省汝南縣東南)人,周訪的孫子,周光的兒子。
晉哀帝興寧初年,督寧州軍事。為振武將軍、寧州刺史。在寧州貪污暴虐,民不堪命。晉廢帝太和六年(371年)再次監益州、豫州、梁州之三郡,益州刺史。晉孝武帝寧康初年,轉鎮梁益二州,前秦苻堅派仇池人楊安率眾攻蜀,周仲孫兵敗免官。後徵為光祿勳,死於任上。