祁酉源(生卒年不詳),清朝末年政治人物。甘肅河州人。
光緒二十七年(1901年)辛丑,廣東、廣西、甘肅、雲南、貴州五省補行庚子恩科鄉試。祁酉源中式甘肅鄉試第一名舉人(解元)。[1]主講臨夏鳳林書院。光緒二十九年(1903年)秋,任西寧縣儒學訓導,卸任後病卒於家。