福建都指揮使司，明朝十六個都指揮使司之一。
洪武七年（1374年）二月置福州都衛，治福州府。洪武八年（1375年）十月改福州都衛為福建都指揮使司。洪武九年（1376年）六月改福建等處行中書省為福建承宣布政使司。福建都指揮使司屬於前軍都督府。
福州中衛、福州左衛、福州右衛、興化衛、泉州衛、漳州衛、福寧衛、鎮東衛、平海衛、永甯衛、鎮海衛
後來改制：
