順反組
順反組（英語：cistrome）指的是「全基因組尺度下反式作用因子的順式作用靶點的集合，也可以說是在體情況下轉錄因子結合位點或組蛋白修飾在全基因組上的位置」[1]。「順反組」這一術語是cistron（順反子）和genome（基因組）的混成詞，最初由達納-法伯癌症研究所和哈佛醫學院的研究者命名[2]。
染色質免疫沉澱等技術結合微陣列分析「ChIP-on-chip」或大規模並行DNA測序「ChIP-Seq」極大地方便了對轉錄因子及其它染色質相關蛋白的順反組的定義。
參考文獻
編輯- ^ Liu T, Ortiz JA, Taing L, Meyer CA, Lee B, Zhang Y, Shin H, Wong SS, Ma J, Lei Y, Pape UJ, Poidinger M, Chen Y, Yeung K, Brown M, Turpaz Y, Liu XS. Cistrome: an integrative platform for transcriptional regulation studies. Genome Biol. 2011, 12 (8): R83. PMC 3245621
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- ^ cistrome / FrontPage. PBWiki, Inc. （原始內容存檔於2021-01-22）.
深入閱讀
編輯- Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M. FoxA1 translates epigenetic signatures into enhancer-driven lineage-specific transcription. Cell. March 2008, 132 (6): 958–70. PMC 2323438 . PMID 18358809. doi:10.1016/j.cell.2008.01.018.
- Lupien M, Brown M. Cistromics of hormone-dependent cancer. Endocr. Relat. Cancer. June 2009, 16 (2): 381–9. PMID 19369485. doi:10.1677/ERC-09-0038.