Plazi是一家以支持和促進數字生物分類學文獻的長期、公開訪問為目的的國際非營利性組織,總部位於瑞士。Plazi是生物多樣性文獻庫(Biodiversity Literature Repository)的共同創立者。該組織使用TreatmentBank服務,將分類學出版物的數據轉化為XML格式的FAIR數據,並在Zenodo上建立並維護可供公開訪問的生物多樣性文獻庫(Biodiversity Literature Repository)。[1][2]Plazi致力於宣傳科學討論和科學數據的開放獲取的重要意義,它是生物多樣性信息學領域中快速發展的在線分類學的貢獻者。[3]

該方式最初由美國國家科學基金會德國科學基金會美國自然史博物館卡爾斯魯厄理工學院的共同合作開發的。該方式試圖創建使用XML格式對生物系統文獻的內容進行建模分類。舊的學術出版物則使用GoldenGATE的半自動編輯器創建的TaxonX格式。[4]

當下,Plazi依然在使用GoldenGATE作為一個複雜的標記工具,從而允許學術界參與並提高文檔質量。[5][6]

Plazi開發了多種方法,可通過全球生物多樣性信息設施(GBIF)收集的TAPIR服務訪問當前已發布的分類學文獻中的數據記錄。[7]同時可通過物種頁面模型(SPM)傳輸模式,從而獲取第三方機構,如生命百科全書(EOL)的分類數據(物種和更高分類群的科學描述)。目前,達爾文核心檔案(DwC-A)傳輸到全球生物多樣性信息設施(GBIF)的數據為33,623個數量集,占GBIF中所有數據集的比重超過50%。[8]並且在可行的前提下,Plazi通過與外部資料庫(如GenBank膜翅目名稱伺服器ZooBank(動物學名稱註冊處))的網絡連結來提高文檔質量。

Plazi聲稱其支持版權法規,辯解稱生物學分類並不屬於文學或藝術作品的範圍。因此Plazi認為這部分作品屬於公共領域,在科學實踐需要的前提下可以自由使用和傳播。[9][10]

參見

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參考資料

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  1. ^ TreatmentBank. plazi.org. [2020-02-09]. (原始內容存檔於2021-05-29). 
  2. ^ Catapano, Terry. Taxpub. Plazi. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2022-05-06). 
  3. ^ Zauner, H. Evolving e-taxonomy. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 141. PMC 2714837 . PMID 19555493. doi:10.1186/1471-2148-9-141. 
  4. ^ Sautter, Guido. GoldenGATE Editor. Plazi, Technische Hochschule Karlsruhe. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2022-01-19). 
  5. ^ Agosti, Donat; Guidoti, Marcus; Sautter, Guido. Liberating the Richness of Facts implicit in taxonomic Publication: ThePlaziWorkflow. Biodiversity Information Science and Standards. 2020, 4 (e59179). doi:10.3897/biss.4.59179 (英語). 
  6. ^ Agosti, Donat; Egloff, Willi. Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2008, 2 (53). doi:10.1186/1756-0500-2-53 (英語). 
  7. ^ Plazidata in GBIF. Plazi. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2016-03-03). 
  8. ^ Plazi.org taxonomic treatments database. gbif.org. [2021-04-25]. (原始內容存檔於2022-03-12). 
  9. ^ Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2009, 2: 53. PMC 2673227 . PMID 19331688. doi:10.1186/1756-0500-2-53. 
  10. ^ Costello M J. Motivating Online Publication of Data. BioScience. 2009, 59:5 (5): 418 [2009-10-27]. doi:10.1525/bio.2009.59.5.9. (原始內容存檔於2011-08-07). 

外部連結

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