VMD
VMD(英語：Visual molecular dynamics, 可視化分子動力學)是一套分子建模與可視化軟體[2]，主要用來分析分子動力學模擬的實驗數據。同時，軟體也包含處理長度與提及相關數據的模塊，能可視化與分析軌跡，添加任意圖形，並能導出成其他軟體能利用的格式例如POV-Ray，PRMan，VRML等。用戶能運行Tcl和Python腳本進行批量操作，也可通過Tcl/Tk與其他程序進行交互。VMD能在Unix，MacOS，Microsoft Windows等作業系統下運行[3]。對於非商業用途，VMD通過特定分發協議發布，用戶註冊後可免費使用和修改源碼[4]。
 VMD 1.8.3 軟體截圖. | |
| 原作者 | 威廉·漢弗萊，安德魯·達爾克，克勞斯·舒爾頓，約翰·斯通 |
|---|---|
| 開發者 | UIUC |
| 首次發布 | 1995年7月4日 |
| 當前版本 | 1.9.2（2014年12月） |
| 作業系統 | OS X, Unix, Windows |
| 語言 | English |
| 類型 | 分子建模 |
| 許可協議 | 需註冊(Distribution-specific)[1] |
| 網站 | www |
外部連結
編輯
參考資料
編輯- ^ VMD license. [2017-01-03]. （原始內容存檔於2022-01-21）.
- ^ Humphrey, William; Dalke, Andrew; Schulten, Klaus. VMD: Visual molecular dynamics. Journal of Molecular Graphics. February 1996, 14 (1): 33–38. PMID 8744570. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5.
- ^ VMD User's Guide Version 1.9.1 (PDF). Massachusetts Institute of Technology. NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics. [January 29, 2012]. （原始內容 (PDF)存檔於2016-06-09）.
- ^ VMD License. Theoretical and Computational Biophysics Group. NIH Center for Macromolecular Modeling & Bioinformatics, University of Illinois at Urbana–Champaign. [4 January 2016]. （原始內容存檔於2022-01-21）.