卞三元(1616年—1697年),祖籍不詳,汉军镶红旗人,清朝初期政治人物。卞永譽之父。
崇德六年,鄉試中舉,歷任秘書院副理事官。順治元年,擔任山東登州府知府,次年改任揚州府知府。順治三年,任山東按察使司副使、東昌兵備道[1]。同年改任江南布政使司右參議、淮海兵備道[2]。順治九年,升任湖廣按察使司副使[3]。順治十三年,擔任陝西苑馬寺卿。次年,改任山西按察使。順治十六年,以右副都御史[4],任貴州巡撫[5]。順治十八年,改任雲南總督[1]。康熙四年,擔任雲貴總督[6]。
諡恪敏[7]。