埃希氏菌属病毒HK97
埃希氏菌属病毒HK97(学名:Escherichia virus HK97,或称噬菌体HK97或HK97),是一种噬菌体。它们的宿主是埃希氏菌属的细菌[1],主要感染大肠杆菌及其亲属。因此,该病毒被归类为噬菌体。首字母缩写“HK”代表香港,这是首次分离出这些病毒的地方。与λ噬菌体一样,HK97具有双链DNA基因组。[2]
埃希氏菌属病毒HK97![]() | |
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由穿透式电子显微镜(TEM)拍摄的埃希氏菌属病毒HK97,放大倍数为300000x。 | |
病毒分类 ![]() | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 双链DNA病毒域 Duplodnaviria |
界: | 香港病毒界 Heunggongvirae |
门: | 尾噬菌体门 Uroviricota |
纲: | 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes |
目: | 有尾噬菌体目 Caudovirales |
科: | 长尾噬菌体科 Siphoviridae |
属: | 享德里克斯噬菌体属 Hendrixvirus |
种: | 埃希氏菌属病毒HK97 Escherichia virus HK97
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成熟过程
编辑HK97的病毒颗粒具有头及尾的结构:头(衣壳)容纳遗传物质,此处为双链DNA。与细菌宿主细胞对接后,将遗传物质通过尾巴注入宿主。详细过程如下:
HK97的衣壳蛋白gp5在成熟过程中交联形成锁子甲状结构。[3]噬菌体在衣壳中的DNA包装过程中经历了一个成熟过程,在此过程中它膨胀了近5纳米,其几何形状从球形对称变为二十面体对称。
HK97病毒颗粒的组装始于衣壳蛋白gp5的自我组织,以形成五聚体和六聚体。蛋白酶gp4在其N端裂解gp5。HK97附着随后积累的所谓门户蛋白gp3会导致构象改变,从而导致头或前衣壳结构(尚未充满遗传物质的衣壳头)的形成。进一步的构象改变和gp5单体的聚合导致衣壳进一步成熟,并最终导致噬菌体头的形成。[4]与大多数其他具有首尾结构的病毒相反,衣壳组装不需要支架蛋白。[5]然而研究表明,HK97分解主要衣壳蛋白或其部分的δ结构域对组成至为重要。[6]
排除超级感染
编辑“排除超级感染”(SIE)[7]是一种现象,在竞争情况下,现有初始感染的病毒感染会阻止相同或紧密相关的病毒继发感染。但是在许多情况下,人们对其表型了解仍然很少。它可以反映感染细胞的一种抗病毒状态[8][9]。
许多编码蛋白达到噬菌体的SIE。这些病毒蛋白可以干扰DNA释放到宿主细胞质中或修饰进入受体。它们还可以作为病毒肽聚糖降解酶的抑制剂,噬菌体通过这些酶在细菌细胞壁上穿孔,从而阻止了其他新近到达的噬菌体进入。HK97及其SIE蛋白gp15属于这一类噬菌体[8]。
系统
编辑由于形态相似性,该组HK97噬菌体先前被归类为λ噬菌体。根据遗传分析,同时将该组提升为一个独立属。[2][10][11]。
参考资料
编辑- ^ ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4 (页面存档备份,存于互联网档案馆), EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ^ 2.0 2.1 ICTV: ICTV Master Species List 2018b.v2 (页面存档备份,存于互联网档案馆) MSL #34v
- ^ Helgstrand, Charlotte; Wikoff, William R; Duda, Robert L; Hendrix, Roger W; Johnson, John E; Liljas, Lars. The Refined Structure of a Protein Catenane: The HK97 Bacteriophage Capsid at 3.44Å Resolution. Journal of Molecular Biology. 1 December 2003, 334 (5): 885–899. PMID 14643655. doi:10.1016/j.jmb.2003.09.035.
- ^ Hendrix, RW; Johnson, JE. Bacteriophage HK97 capsid assembly and maturation.. Advances in Experimental Medicine and Biology. 2012, 726: 351–63. ISBN 978-1-4614-0979-3. PMID 22297521. doi:10.1007/978-1-4614-0980-9_15.
- ^ Genetic basis of bacteriophage HK97 prohead assembly. J. Mol. Biol. 1995, 247 (4): 636–47. PMID 7723020. doi:10.1006/jmbi.1994.0169.
- ^ The delta domain of the HK97 major capsid protein is essential for assembly. Virology. 2014,. 456-457: 171–8. PMC 4044616 . PMID 24889236. doi:10.1016/j.virol.2014.03.022.
- ^ Knut J. Heller, Horst Neve: Superinfection exclusion und DNA-Injektion bei Siphoviridae-Phagen (页面存档备份,存于互联网档案馆), Biospektrum Heft 1 (2014), S. 26–29
- ^ 8.0 8.1 SIB: Superinfection exclusion (页面存档备份,存于互联网档案馆), auf: ExPASy ViralZone
- ^ Vergleiche auch Influenza-A- und Rhinoviren: Nadja Podbregar: Grippe schützt vor Erkältung – Forscher weisen erstmals Wechselwirkung zweier viraler Krankheitserreger nach (页面存档备份,存于互联网档案馆), auf: scinexx.de vom 17. Dezember 2019
- ^ NCBI: Hendrixvirus (genus)
- ^ NCBI: unclassified Hendrixvirus