同源框

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同源(异形)框(英语:Homeobox),或称“同源匣”是某些影响动物真菌植物发育的基因所拥有的一段DNA序列,拥有同源框的基因称作同源异形基因,统称同源异形基因家族。

Homeodomain
The Antennapedia homeodomain protein from Drosophila melanogaster bound to a fragment of DNA.[1] The recognition helix and unstructured N-terminus are bound in the major and minor grooves respectively.
鉴定
标志同源框结构域(Homeodomain)
PfamPF00046旧版
Pfam宗系CL0123旧版
InterPro英语InterProIPR001356
SMART英语Simple Modular Architecture Research ToolSM00389
PROSITE英语PROSITEPDOC00027
SCOP英语Structural Classification of Proteins1ahd / SUPFAM

这段序列之长度约180个核苷酸,能转录出一段蛋白质结构域,称为同源框结构域(Homeodomain)。

概述

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同源框长约180个碱基对,编码可与DNA结合的蛋白质位点(同源域)。同源框基因编码的转录因子通常会开启一系列其他基因,例如形成腿所需的所有基因。同源框结构域特异性结合DNA。然而,单一同源域蛋白的特异性通常不足以仅识别其所需的目标基因。在大多数情况下,同源性域蛋白在其目标基因的启动子区域中发挥作用,通常与其他转录因子和同源性域蛋白形成复合物。此类复合物比单一同源域蛋白具有更高程度的标靶特异性[2][3]

参见

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参考文献

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  1. ^ PDB 1AHD; Billeter M, Qian YQ, Otting G, Müller M, Gehring W, Wüthrich K. Determination of the nuclear magnetic resonance solution structure of an Antennapedia homeodomain-DNA complex. Journal of Molecular Biology. Dec 1993, 234 (4): 1084–93. PMID 7903398. doi:10.1006/jmbi.1993.1661. 
  2. ^ Gehring, W. J. The homeobox in perspective. Trends in Biochemical Sciences. August 1992, 17 (8): 277–280. ISSN 0968-0004. PMID 1357790. 
  3. ^ Bürglin, Thomas R.; Affolter, Markus. Homeodomain proteins: an update. Chromosoma. 06 2016, 125 (3): 497–521. ISSN 1432-0886. PMC 4901127 . PMID 26464018. doi:10.1007/s00412-015-0543-8.