Rm1病毒
蝙蝠冠状病毒Rm1（Bat SARS CoV Rm1/2004）是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒（SARSr-CoV）的一个病毒株，为SARS-CoV相关病毒，在中国湖北的大耳菊头蝠样本中发现，于2005年发表。
Rm1病毒
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病毒分类 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | Rm1病毒 SARSr-CoV
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| 毒株： | Rm1病毒 Rm1
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发现 编辑
2004年3月至11月，研究人员在中国广东、天津、广西与湖北四省市采集蝙蝠样本，在湖北宜昌皮氏菊头蝠的粪便样本中发现SARS相关病毒，即Rm1病毒，于2005年和Rf1病毒与Rp3病毒一起发表[1]。
基因组 编辑
Rm1病毒的基因组长29749nt[2]，序列与SARS-CoV的相似度为88.2%[3]，其ORF8和人类以外的大多数SARSr-CoV一样有一段长29nt的插入序列，为一完整的开放阅读框，人类的ORF8则因缺少此序列而被分成8a与8b两个较小的开放阅读框。Rm1的ORF8（121个氨基酸）比人类SARS病毒ORF8辅助蛋白（121个氨基酸）少一个氨基酸，且两者氨基酸序列相似度仅35%[1]。另外Rm1与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）有两段分别长5和12个氨基酸的序列缺失（但不见于WIV1病毒与SHC014病毒）[4]。
参考文献 编辑
- ^ 1.0 1.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391.
- ^ Bat SARS coronavirus Rm1, complete genome. NCBI. [2021-01-28]. （原始内容存档于2021-04-13）.
- ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.
- ^ Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.