蝙蝠冠狀病毒Rm1(Bat SARS CoV Rm1/2004)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,為SARS-CoV相關病毒,在中國湖北大耳菊頭蝠樣本中發現,於2005年發表。

Rm1病毒
病毒分類 編輯
(未分級) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
門: 小核糖病毒門 Pisuviricota
綱: 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠狀病毒科 Coronaviridae
屬: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亞屬: SARS乙型冠狀病毒亞屬 Sarbecovirus
種:
Rm1病毒 SARSr-CoV
毒株
Rm1病毒 Rm1

發現

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2004年3月至11月,研究人員在中國廣東天津廣西湖北四省市採集蝙蝠樣本,在湖北宜昌皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒,即Rm1病毒,於2005年和Rf1病毒Rp3病毒一起發表[1]

基因組

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Rm1病毒的基因組長29749nt[2],序列與SARS-CoV的相似度為88.2%[3],其ORF8和人類以外的大多數SARSr-CoV一樣有一段長29nt的插入序列,為一完整的開放閱讀框,人類的ORF8則因缺少此序列而被分成8a與8b兩個較小的開放閱讀框。Rm1的ORF8(121個胺基酸)比人類SARS病毒ORF8輔助蛋白(121個胺基酸)少一個胺基酸,且兩者胺基酸序列相似度僅35%[1]。另外Rm1與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域(receptor binding domain, RBD)有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失(但不見於WIV1病毒SHC014病毒[4]

參考文獻

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  1. ^ 1.0 1.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  2. ^ Bat SARS coronavirus Rm1, complete genome. NCBI. [2021-01-28]. (原始內容存檔於2021-04-13). 
  3. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15. 
  4. ^ Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.