軍屯郡，中國南北朝時設置的郡。
北周武帝建德三年（574年）置軍屯郡，治所在建始縣（今湖北恩施土家族苗族自治州建始縣東三十五里州基山下），隸屬於業州，為州治，下轄建始縣一縣。隋文帝開皇三年（583年）廢軍屯郡，建始縣直屬業州。
