UBTF

位於17號人類染色體的基因

核仁轉錄因子1(Nucleolar transcription factor 1)又叫上游結合轉錄因子(Upstream binding transcription factor,縮寫UBTF)或上游結合因子1(Upstream binding factor 1,縮寫UBF1)是一種由人類基因UBTF 所編碼的蛋白質[1][2]

Upstream binding transcription factor, RNA polymerase I
RNA聚合酶I上游結合因子
PDB rendering based on 1k99.
有效結構
PDB 直系同源檢索:PDBe, RCSB
標識
代號 UBTF; NOR-90; UBF; UBF-1; UBF1
擴展標識 遺傳學600673 鼠基因98512 同源基因7970 GeneCards: UBTF Gene
RNA表達模式
更多表達數據
直系同源體
物種 人類 小鼠
Entrez 7343 21429
Ensembl ENSG00000108312 ENSMUSG00000020923
UniProt P17480 A2AWT5
mRNA序列 NM_001076683 NM_001044383
蛋白序列 NP_001070151 NP_001037848
基因位置 Chr 17:
42.28 – 42.3 Mb
Chr 11:
102.3 – 102.32 Mb
PubMed查詢 [1] [2]

功能

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UBTF是18S5.8S28S的核糖體RNA的轉錄所必須的轉錄因子,和SL1因子(一個四聚體,包括一個TATA結合蛋白和3個轉錄輔助因子TAF1英語TAF1)共同起作用。在人體中存在94和97kD的兩種UBF多肽鏈。UBF是一種核仁磷酸化蛋白(nucleolar phosphoprotein),同時具有DNA結合結構域和反式激活結構域,通過HMG盒結合到人rRNA啟動子的核心與上游部位。[2]

相互作用

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UBTF已知能與酪蛋白激酶2α亞基英語Casein kinase 2, alpha 1[3]TAF1C[4][5]視網膜母細胞瘤蛋白[6]TAF1[7]進行交互作用

參考文獻

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  1. ^ Matera AG, Wu W, Imai H, O'Keefe CL, Chan EK. Molecular cloning of the RNA polymerase I transcription factor hUBF/NOR-90 (UBTF) gene and localization to 17q21.3 by fluorescence in situ hybridization and radiation hybrid mapping. Genomics. May 1997, 41 (1): 135–8. PMID 9126496. doi:10.1006/geno.1997.4647. 
  2. ^ 2.0 2.1 Entrez Gene: UBTF upstream binding transcription factor, RNA polymerase I. 
  3. ^ Voit, R; Kuhn A, Sander E E, Grummt I. Activation of mammalian ribosomal gene transcription requires phosphorylation of the nucleolar transcription factor UBF. Nucleic Acids Res. (ENGLAND). July 1995, 23 (14): 2593–9. ISSN 0305-1048. PMC 307079 . PMID 7651819. doi:10.1093/nar/23.14.2593. 
  4. ^ Voit, R; Grummt I. Phosphorylation of UBF at serine 388 is required for interaction with RNA polymerase I and activation of rDNA transcription. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (United States). November 2001, 98 (24): 13631–6. ISSN 0027-8424. PMC 61092 . PMID 11698641. doi:10.1073/pnas.231071698. 
  5. ^ Zhai, W; Comai L. Repression of RNA Polymerase I Transcription by the Tumor Suppressor p53. Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES). August 2000, 20 (16): 5930–8. ISSN 0270-7306. PMC 86070 . PMID 10913176. doi:10.1128/MCB.20.16.5930-5938.2000. 
  6. ^ Hannan, K M; Hannan R D, Smith S D, Jefferson L S, Lun M, Rothblum L I. Rb and p130 regulate RNA polymerase I transcription: Rb disrupts the interaction between UBF and SL-1. Oncogene (ENGLAND). October 2000, 19 (43): 4988–99. ISSN 0950-9232. PMID 11042686. doi:10.1038/sj.onc.1203875. 
  7. ^ Lin, Chih-Yin; Tuan JoAnn, Scalia Pierluigi, Bui Tiffany, Comai Lucio. The cell cycle regulatory factor TAF1 stimulates ribosomal DNA transcription by binding to the activator UBF. Curr. Biol. (England). Dec 2002, 12 (24): 2142–6. ISSN 0960-9822. PMID 12498690. doi:10.1016/S0960-9822(02)01389-1. 

延伸閱讀

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