商琦,字德符,元朝曹州濟陰(今山東省菏澤市)人,商挺第五子。
大德八年(1304年),元成宗召商琦備宿衛。元武宗時,元仁宗在東宮,奏授商琦為集賢直學士。調任大名路治中,沒有就任。皇慶元年(1312年),授集賢侍講學士。延祐四年(1317年),升為侍讀官、通奉大夫,賜鈔二萬五千貫。泰定元年(1324年),轉任秘書卿,因病歸鄉,去世。商琦善畫山水。在四川為官,持平守法,秋毫無私。