基因組島
基因組島(英語:Genomic island,GI)是指一個基因組中,有證據顯示可能來源於基因水平轉移的一段[1]。這一術語通常用於描述微生物,特別是細菌的基因組。GI中的基因可以編碼多種功能的蛋白質,可以參與細菌共生或病理過程,並且可以幫助微生物適應環境。例如,和病原微生物發病機制相關的GI通常被稱為致病島(Pathogenicity island,PAI,或譯為毒力島),帶有許多抗生素抗性基因的GIs通常被稱作抗生素抗藥性島(antibiotic resistance island,簡稱抗藥島)。相同的GI可以通過各種基因水平轉移方式(如轉化、轉導、接合)而出現在親緣關係較遠的微生物基因組中,這使得科學家可以通過鹼基CG含量比的不同,以及系統發生樹分析找出基因組島。
例子
編輯在許多細菌的基因組中,III型分泌系統和IV型分泌系統都位於基因組島上。
另見
編輯參考文獻
編輯- ^ Langille, MG; Hsiao, WW; Brinkman, FS. Detecting genomic islands using bioinformatics approaches.. Nature Reviews. Microbiology. May 2010, 8 (5): 373–82. PMID 20395967. doi:10.1038/nrmicro2350.