已測序真核生物基因組列表
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已測序真核生物基因組列表包括所有已知的，可以公開獲取已組裝、註釋和發表的細胞核和細胞器基因組序列的真核生物；基因組草圖不包括在內，只有細胞器序列的物種也不包括。
1977年，第一次出現DNA測序。1995年，細菌流感嗜血桿菌第一個完成了全基因組序列。1996年，釀酒酵母是第一個發佈的真核生物基因組序列。1998年，發佈了第一個多細胞真核生物基因組序列，秀麗隱杆線蟲。
原生生物
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植物
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| 物種學名 | 類型 | 意義 | 基因組大小 | 預測的基因數 | 完成機構 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana 生態型:哥倫比亞 |
擬南芥 | 模式植物 | 119 Mb | 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) | Arabidopsis Genome Initiative[3] | 2000[1] |
| Cyanidioschyzon merolae Strain:10D |
紅藻 | 單細胞真核生物 | 16.5 Mb | 5,331[4] | University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University | 2004[4] |
| Oryza sativassp ssp indica |
大米 | Crop and model organism | 420 Mb | 32-50,000[5] | Beijing Genomics Institute、浙江大學、中國科學院 | 2002[5] |
| Ostreococcus tauri | 綠藻 | 單細胞真核生物，基因組較小 | 12.6 Mb | 7,969 (UniProt) | Laboratoire Arago | 2006[6] |
| Populus trichocarpa | Balsam poplar or Black Cottonwood | 固碳模式植物，商業木材and comparison to A. thaliana | 550 Mb | 45,555[7] | The International Poplar Genome Consortium | 2006[7] |
真菌
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| 物種 | 綱 | 意義 | 基因組大小 | 預測基因數目 | 完成機構 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 品系：S288C |
酵母菌綱 | 用於釀造啤酒的酵母；常用的模式生物 | 12.1 Mb | 6,294[8] | 大規模國際合作項目[9] | 1996[8] |
| 家兔腦胞內原蟲 Encephalitozoon cuniculi |
微孢子蟲綱 | 人類病原體 | 2.9 Mb | 1,997[10] | Genoscope和Université Blaise Pascal | 2001[10] |
| 粟酒裂殖酵母 Schizosaccharomyces pombe 品系：972h- |
裂殖酵母綱 | 模式生物 | 14 Mb | 4,824[11] | 桑格研究所和冷泉港實驗室 | 2002[11] |
| 粉色麵包黴菌 Neurospora crassa |
糞殼菌綱 | 模式生物 | 40 Mb | 10,082[12] | Broad Institute、俄勒岡健康與科學大學、肯塔基大學和堪薩斯大學 | 2003[12] |
| 黃孢原毛平革菌 Phanerochaete chrysosporium 品系：RP78 |
傘菌綱 | 木材腐朽真菌；常用於真菌修復 | 30Mb | 11,777[13] | Joint Genome Institute | 2004[13] |
動物
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| 物種 | 類型 | 意義 | 基因組大小 | 預測的基因數目 | 完成機構 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 秀麗隱桿線蟲 Caenorhabditis elegans 品系：Bristol N2 |
線蟲動物門 | 模式動物 | 100 Mb | 19,000[14] | 華盛頓大學和維康桑格研究所 | 1998[14] |
| 黑腹果蠅 Drosophila melanogaster |
果蠅 | 模式動物 | 165 Mb | 13,600[15] | 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校、貝勒醫學院、歐洲DGP | 2000[15] |
| 岡比亞瘧蚊 Anopheles gambiae 品系：PEST |
蚊子 | 瘧疾的載體 | 278 Mb | 13,683[16] | 塞雷拉基因組公司和法國國家基因測序中心 | 2002[16] |
| 紅鰭東方魨 Takifugu rubripes |
四齒魨科 | 脊椎動物中的最小基因組 | 390 Mb | 22–29,000[17] | 國際河豚基因體協會[18] | 2002[19] |
| 智人 Homo sapiens |
哺乳動物 | 3.2 Gb[20] | 18,826（CCDS估計） | 人類基因組計劃委員會和塞雷拉基因組公司 | 草圖：2001[21][22] 完成：2006[23] |
參見
編輯
參考資料
編輯- ^ 1.0 1.1 The Arabidopsis Genome Initiative,. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
- ^ Ensembl entry. [2012-03-08]. （原始內容存檔於2020-07-24）.
- ^ Arabidopsis Genome Initiative 互聯網檔案館的存檔，存檔日期2006-02-07.
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外部連結
編輯- Diark - a resource for eukaryotic genome research （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- EMBL-EBL Eukaryotic Genomes
- UCSC Genome Browser （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- Ensembl （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
- Fungal Genome Initiative （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） (includes draft genomes)
- GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- SUPERFAMILY comparative genomics database （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
- Rat Genome Database （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）