種子島氏(日語:種子島氏/たねがしまし Tanegashima Shi)是日本九州地區的一個氏族。
根據種子島氏的家譜,這個氏族是鐮倉時代初期平清盛之孫平行盛的遺孤,被北條時政收為養子送入種子島。初代信基自稱是平氏。
種子島氏最為人所知的事件就是在第14代當主時堯時期的鐵炮傳入日本。