新壁總域
一個假定的生物演化支，包含古菌與真核生物
新壁總域（Neomura）是一個演化支，由古菌域和真核生物域兩域生物所組成。這個概念是由2002年被湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯所提出[2]。他假設新壁總域成員演化自真細菌，其中一個主要的改變是細胞壁的成分以醣蛋白取代肽聚糖。
新壁總域 化石時期：
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| 各種真核生物例子 | |
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| Halobacterium，古菌的一屬 | |
科學分類 
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| 總域： | 新壁總域 Neomura Cavalier-Smith et al., 2002 |
| 域[1] | |
形態學
編輯新壁總域是一個非常繁雜的群體，它含括了所有的多細胞生物，以及大部分的嗜極生物。雖然成員的形態學看起來相當不同，但在分子細胞學領域具有許多相同特徵。所有的新壁總域都擁有組織蛋白去幫忙包裝染色體，且具有其他類別生物沒有的內含子。此類生物都使用因子甲硫氨酸作為蛋白質合成的起始氨基酸（真細菌則使用N-甲酰甲硫氨酸）。另外，所有新壁總域成員具有好幾種RNA聚合酶，而真細菌只有一種。
解釋
編輯關於新壁總域在系統發生樹的位置，學界看法不一，但主要可分為兩大理論：
三域觀點
編輯當卡爾·烏斯第一次提出三域系統理論的時候，他相信真細菌域、古菌域，和真核生物域三者同時出現，且在系統發生樹中互為姊妹群。但後來許多證據顯示古菌和真核生物間的關係比其他細菌更相近。這些證據包含這兩域的生物都可使用膽固醇和蛋白酶體等複雜分子。這在大部分的細菌中是沒有的，只有新壁總域中才會擁有。種種證據顯示，真細菌域和古菌域在演化樹應為同一個演化支。因此假說認為自最後共同祖先（LUCA）之後，後代可以分為兩大演化支，即新壁總域和真細菌域。
系統發生樹觀點
編輯湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯和他的合作夥伴，在2002年和之後的論文中提出新壁總域為放線菌門的姊妹群[2]。分子證據包含前述膽固醇和蛋白酶體等複雜分子的合成，合成的分子越是複雜，趨同演化的可能性就越低，除非兩個合成途徑發生了水平轉移，但這種機會並不大，因此學界通常支持兩者同源。
| LUCA |
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參見
編輯參考文獻
編輯- ^ 1.0 1.1 Cavalier-Smith T. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol. Direct. 2006, 1: 19 [2017-05-21]. PMC 1586193
. PMID 16834776. doi:10.1186/1745-6150-1-19. （原始內容存檔於2019-12-18）.
- ^ 2.0 2.1 Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354 [2017-05-21]. PMID 11931142. doi:10.1099/00207713-52-2-297. （原始內容存檔於2017-07-29）.
延伸閱讀
編輯
- Cavalier-Smith T. The origin of eukaryotic and archaebacterial cells. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1987, 503: 17–54 [2017-05-21]. PMID 3113314. doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x. （原始內容存檔於2013-01-05）.
- Cavalier-Smith T. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. January 2002, 52 (Pt 1): 7–76. PMID 11837318. doi:10.1099/00207713-52-1-7.
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- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA. Evidence for a gram-positive, eubacterial root of the tree of life. Mol. Biol. Evol. August 2007, 24 (8): 1761–8 [2017-05-21]. PMID 17513883. doi:10.1093/molbev/msm096. （原始內容存檔於2020-06-02）.
- Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. The archaebacterial origin of eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008-12-10, 105 (51): 20356–20361. PMC 2629343 . PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105.
- Cavalier-Smith, T. The Neomuran Revolution and Phagotrophic Origin of Eukaryotes and Cilia in the Light of Intracellular Coevolution and a Revised Tree of Life. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2014-09-02, 6 (9): a016006–a016006. PMC 4142966 . PMID 25183828. doi:10.1101/cshperspect.a016006.