黃配玄(?—1645年),字承文,號位兩,江西撫州府樂安縣(今江西省樂安縣)人,明朝政治人物,同進士出身。
萬曆四十三年(1615年)乙卯科舉人,崇禎七年(1634年),登甲戌科進士[1],吏部觀政,十月授南直隸望江縣知縣,八年調任懷寧縣知縣[2]。此後升任南京兵科給事中[2]。崇禎十四年(1641年),任安廬巡撫[3]。丁內艱去。